Eski CHP genel başkanı ve Antalya milletvekili Deniz Baykal, Cumhuriyet Gazetesi'ne yapılan operasyona ilişkin olarak, ''Hukuki, adli değil, siyasi ve idari bir karardır” dedi. Ahmet Hakan da, Gülen cemaati mensuplarının 'yurt dışında kendilerine malzeme' aradıklarını ifade ederek "Cumhuriyet operasyonuyla FETÖ’cülere muhteşem bir fırsat verildi" dedi.
Baykal, 7 Haziran seçimi sonrası oluşan ortamı değerlendirerek "7 Haziran’da uzlaşma olsaydı darbe olmazdı. İhtiyacımız olan uzlaşma" ifadesini kullandı.
Baykal, operasyonun ‘FETÖ’ soruşturmalarını sulandıracağını ifade ederken ”Yargıyla ilgili çok ciddi kaygı verici bir tablonun bulunduğu bu operasyonla ortaya çıkmıştır. Savcılık çok ince biçimde bir açıklama yaptı. Savcılık ince bir yaklaşım içine girmiş. Açıklamada diyorki, FETÖ’cü ve PKK üyesi olmamakla birlikte onlar adına suç işleyen kişileri soruşturmak üzere’’ diyor. Bunun inandırıcı bir yönü yok”” dedi.
Baykal, 15 Temmuz darbe girişiminden sonra Gülhane Askerî Tıp Akademisi’nin (GATA) sivilleştirilip adının 'Haydarpaşa Sultan Abdülhamid Eğitim ve Araştırma Hastanesi' olarak değiştirilmesini eleştirerek, “Kurum mu suçlu, sen suçlusun” dedi.
Baykal, CNN Türk'te Ahmet Hakan'ın Tarafsız Bölge programında Abdulkadir Selvi ve Hande Fırat'ın sorularını yanıtlıyor.